针对日本19日下午决定继续非法扣押中国船长一事，此间专家指出，这将严重损害中国民众对日本的好感与信任，并对两国近些年较为良性的互动产生极为负面的影响。
他们表示，中国目前已出台系列反制措施，并且不排除还有后续动作。日本应该认真考虑继续非法扣押中国船长可能要付出的代价。
“日本是中国重要的邻国，也是大国。国际关系中的基本因素是信任。日本此举，有损中国人对日本的好感与信任，有损中日正逐步建立的战略互信，有损两国共同发展的需求。”中共中央党校国际战略研究所副教授赵磊说。
他认为，目前日本的战略重心正转向亚洲，日本未来的发展其实很需要中国的支持，做出这种不克制的事情会有损日本自身利益，对其长远发展并无好处。他强调，中日关系中的信任要以日本对中国核心利益的尊重为基本要求。
中国社科院世界经济与政治研究所徐进博士表示，日方对在钓鱼岛海域作业的中国渔船使用日本国内法，不仅严重损害中国主权，也使中国民间存在的对日不信任感升高。
“日本这样做根本是不尊重人权。船长奶奶过世、中秋佳节临近，却仍将人扣押不放，以试图达到自己不可告人的政治目的，这是极端不人道的做法，应该受到世人谴责。”北京大学国际关系学院副教授张植荣表示。
19日晚，外交部副部长王光亚指出，日方如不立即无条件放回中方船长，中方将采取强烈反制措施，其一切后果由日方承担。王光亚强调，日方制造的这起事件已经对中日关系造成了严重损害，今后事态如何发展，完全取决于日方做何选择。
目前中方已经暂停双边省部级以上交往，中止了双方有关增加航班、扩大中日航权事宜的接触，推迟了中日煤炭综合会议。中国公民赴日旅游规模也已经受到严重影响。
“政治层面暂停中日省部级以上交往，意味着日本的知县、大臣、阁僚不能到中国访问，两国往来有所限制。这一反制措施是中日邦交正常化38年来从未有过的。”中国社科院日本研究所副所长高洪说，在政治关系受到损害的前提下，两国已拓宽的经济领域合作也会受到影响。
目前中国内地民间自发停止了万人赴日旅游计划，香港公民也提出减少赴日旅游。如果日本政府不采取措施，减少赴日旅游的影响将扩大到整个中国。
日本民主党执政后，大力推行观光立国政策，将中国视为最大目标，并计划将中国赴日游客从2009年的101万人次增加到6年后的600万人次。
“目前中国游客平均在日消费1万元人民币左右，届时每年赴日中国游客将消费600亿元。日本政府这样莽撞行事，中国游客不可能还每年给它送去‘百亿大礼’。”高洪表示。
新加坡国立大学东亚研究所所长郑永年指出，日本这次的行为实际上是日本政府在迎合国内部分民族主义人士的情绪，这样的行为于日本长远利益无益。
他认为，日本的经济复苏离不开中国。在中日贸易中，中方一直处于逆差状态。日本国内的民族主义分子只是一部分力量，日本国内还有相当一部分人士，他们从日益加深的中日经贸往来当中获利，中国应该调动他们的力量，为中日关系发展服务。
赵磊副教授说，国家间信任的建立需要彼此的良性互动。在历史上，日本对中国曾经造成过伤害，日本应该做更多有利于缓解中日紧张情绪的积极贡献去弥补。
