在国家质检总局完成乳制品企业生产许可的审核工作的同时，国家工商总局要求乳制品销售经营环节申领流通许可证。
国家工商总局3月28日下发通知，决定在《食品流通许可证》经营项目中增设含婴幼儿配方乳粉的乳制品和不含婴幼儿配方乳粉乳制品项目，并规定从 4月1日起，凡准备经营销售乳制品的，必须到工商部门申领相应的《食品流通许可证》；已从事乳制品经营的，须在今年 7月底前主动到工商部门申请变更许可项目和经营范围。
根据通知，从今年8月1日开始，凡经营者所持《食品流通许可证》和营业执照经营范围中，没有乳制品标注项目而继续销售乳制品的，或所持《食品流通许可证》和营业执照经营范围中没有“含婴幼儿配方乳粉乳制品”项目而继续销售婴幼儿配方乳粉的，一律依法查处。对无证无照经营乳制品的，依法取缔。
国家工商总局已要求各级工商部门，切实加强乳制品市场监督检查，依法查处乳制品经营违法行为，要求基层工商所开展乳制品市场日常巡查工作，建立健全乳制品信用分类监管制度和“黑名单”制度，激励守信者，惩戒失信者，引导和监督乳制品经营者不断提高自律水平。
质检、工商、商务、农业等部门正在完善乳品追溯制度，加快建立全国统一的乳制品生产经营等信息数据库，今年6月开始向有关乳制品进货单位提供验证验票查询服务，实现从奶源、采购、生产、出厂、运输到销售终端的全程有效监管。质检和工商部门凡发现乳品生产经营单位未按规定记录、造成产品无法准确溯源的，或未验证产品真伪即购进的，依法责令停产停业，直至吊销许可证。
影响
中银国际研究所发布的一份报告对此次乳制品行业整顿分析认为，整顿对降低乳制品行业食品安全事件概率帮助很大，有利于整个乳品行业的健康有序发展，有利于提升消费者对乳品市场的信心。
报告指出，大量乳制品企业停产，使得奶源供应缺口有望收窄，有利于缓解奶源收购环节的恶性竞争局面，对于缓解企业原料成本压力有一定帮助，同时企业的产能利用率也会有所提高，这会进一步使企业更注重乳制品质量。
报告还指出，目前国产奶粉和进口奶粉整体市场份额接近，但高端婴幼儿奶粉市场当中进口奶粉领先优势明显，随着政府对奶粉生产和流通环节的监管力度加强，总体上消费者对国产婴幼奶粉的信心会有所提升，其中直接受益的是中低档为主的奶粉企业。
农产品专业分析机构东方艾格分析师陈连芳表示，整顿是国家对于保障生产和流通环节乳制品安全的细化和强调，是对整个乳业产业链监管的完善，肯定会对乳制品行业产生影响。此次整顿，是借助行政手段和政策性促使业内重新洗牌，本次被清理出局的数百家企业，大致上可腾出 20%的市场空间和将近30%的奶业资料，这使得奶业资源和市场份额更多地流向大企业，中国乳业格局将由此发生变化。
那么整顿之后是不是意味着乳制品质量安全百分之百能让人放心？对于这一问题，陈连芳认为，643家通过了生产许可重新审核的企业，政府签发许可证给你，仅是从你现有的硬件条件评审，认为你是够资格来生产乳制品而已，而食品安全的真正掌控仍然在企业的手中，企业每一个领导者、每一个生产人员的社会责任心决定着产品的质量安全。
整顿在给乳制品行业带来积极影响的同时，也带来了这样一些不容忽视的负面事实的存在：首先关闭一大批未获审核通过的企业，使得部分奶农卖奶难，这些奶农大多是个体养殖者，靠卖奶维持生计，若卖奶难问题得不到解决，奶农们生计会变得困难。
其次，这次大整顿中被淘汰的那几百家企业的工人会由此失业，以及被关停企业的债权债务如何处理等等，这些问题若处理得不好，原本属于企业问题就有可能直接上升为社会问题，对社会的稳定产生不利影响。
附1：中国将对六大食品行业进行整顿
根据国务院办公厅发布的《2011年食品安全重点工作安排》，今年中国将突出抓好6个重点食品行业的综合治理，除乳制品外，还有食用油、保健食品、鲜肉和肉制品、食品添加剂以及酒类，这几个行业的整顿，有点已经开始，有的正在准备阶段。 (北京周报整理）
附二：2010年中国乳品进口额大幅增加
据海关统计，2010年1-11月，中国乳制品进出口总金额由2009年同期的 95971.91万美元增长至180761.57万美元，同比增长88.35%，其中进口金额 176759.57万美元，同比增长95.13%，占进出口总贸易额的97.79%。
同期，乳制品进出口总量为699146.90吨，同比增长22.28%，其中进口总量 668279.79吨，同比增长24.34%，占进出口总量的95.59%。
