中日多边竞争更加明显。日本公开游说欧盟各国继续实行对华武器禁运政策，在油气资源、铁矿石等能源、资源市场上与中国竞争。正中国刚刚开完上海合作组织峰会，小泉就急忙出访有关国家挖墙脚。在联合国、东亚区域合作等各种国际场合，中日总呈现竞争态势。
   小泉“ 8.15” 参拜靖国神社，使中日关系陷入冰河期。因为靖国神社里供奉着 14 名甲级战犯，所以小泉过去五次参拜都是避开 8 月 15 日这敏感的日子，而今年他为了所谓的“履行竞选诺言”，为了所谓的“心灵”问题，不顾国内外的一片反对的声浪，执意参拜了靖国神社，并声称“我进行参拜，是因为我认为不应再让曾令他们备受磨难的战争重演”，似乎那场导致数千万人死亡的战争的受难者仅仅是那些战犯和拿着刀枪侵略别国的士兵。面对日本领导人的强盗逻辑，中国政府和人民只能用“挑战国际正义，践踏人类良知”来定位小泉的参拜行为。
    小泉的参拜靖国神社不仅引起中国、韩国、朝鲜等曾遭受过日本军国主义侵略的国家政府和人民的反对，而且日本国内政界、商界、媒体、学者、民众也对小泉的行为纷纷质疑。 2006 年反对的意见由在野党深入执政的自民党核心。日本“经济同友会”更是公开请求小泉停止惨败。根据 2006 年 7 月的民调显示，反对首相参拜靖国神社的日本民众超过 53% 。

 自9 月 20 日，安倍晋三在日本自民党总裁选举中获胜，接着就任日本首相，并且在他当选首相后的第 13 天出访中国，中日关系出现重大转机。
    转机之一，重启首脑对话大门。 10 月 8 日，安倍飞抵北京。胡锦涛等中国领导人分别与安倍进行了会谈和会见。之后，中日两国政府发表了《联合新闻公报》。再次确认发展中日关系要恪守三个政治文件，并就加强政治、经济、文化、安全、民间交流问题达成一致，表示要建立中日战略互惠关系；中方领导人都指出了日本个别领导人参拜靖国神社是造成中日关系面临困难的根本原因，安倍一再表示坚持对侵略历史进行“深刻反省”，坚持“一个中国”的立场。 11 月 18 日， 胡锦涛与安倍晋三在越南河内再次相见。胡锦涛提出要明确两国关系的发展方向，增进两国国民的友好感情，扎实推进互利合作，共同促进亚洲和平、稳定、发展，妥善处理敏感问题的五项建议。安倍建议双方早日启动经济部长级会议，启动能源部门政策对话，共同推动人员往来，启动关于历史问题的共同研究，使东海成为和平、友好、合作之海，加强日中韩三方合作，共同推进东亚区域合作。 两国领导人相隔一月后再次相见， 体现了中日双方改善和发展两国关系的共同意愿，标志着两国关系呈现出新的局面。